Molecular laboratory publications

Publications

We thank a grant for organization of a new laboratory for young researchers at the Yugra State University as part of implementation of the National Project «Science and Universities».

Соглашение о предоставлении субсидии из федерального бюджета на финансовое обеспечение выполнения государственного задания на оказание государственных услуг (выполнение работ) (внутренний номер 075-ГЗ/X4144/854/4) №075-03-2021-072/4 от 29.09.2021 79-п 22.12.2020 «Разработка методики метагеномного анализа для экспресс-оценки воздействий на среду в условиях интенсивного недропользования».


Методические материалы

Филиппова НВ, Звягина ЕА, Дудка ВА, Рудыкина ЕА. 2023. Протоколы работы в молекулярно-генетической лаборатории ЮГУ: методические указания. Югорский государственный университет (скачать pdf)

Звягина ЕА, Филиппова НВ. 2024. Выделение, пробоподготовка и секвенирование тотальной ДНК на Nanopore MinION. Protocols.io (в подготовке)


Статьи в рецензируемых журналах

  • Filippova N.V., Ageev D.V., Basov Yu.M., Bilous V.V., Bochkov D.A., Bolshakov S.Yu., Bushmakova G.N., Butunina E.A., Davydov E.A., Esengeldenova A.Yu., Filippov I.V., Filippova A.V., Gerasimov S.V., Kalinina L.B., Kinnunen J., Korepanov A.A., Korotkikh N.N., Kuzmin I.V., Kvashnin S.V., Mingalimova A.I., Nakonechnyi N.V., Nurkhanov R.N., Popov E.S., Potapov K.O., Rebriev Yu.A., Rezvyi A.S., Romanova S.R., Strus T.L., Sundström C., Svetasheva T.Yu., Tabone M., Tsarakhova S.G., Vasina A.L., Vlasenko A.V., Vlasenko V.A., Yakovchenko L.S., Yakovlev A.A., Zvyagina E.A. , 2022. Crowdsourcing fungal biodiversity: revision of iNaturalist observations in Northwestern Siberia // Nature Conservation Research, 7 (suppl. 1), https://dx.doi.org/10.24189/ncr.2022.023
  • Rebriev YA, Zvyagina EA, 2022. Scleroderma furfuraceum (Boletales, Agaricomycetes)—a new species from the Russian Far East // Phytotaxa, 555 (2), https://doi.org/10.11646/phytotaxa.555.2.5
  • Zvyagina EA, Sazanova NA, Bulyonkova TM, 2022. Suillus paluster and S. ochraceoroseus (Boletales) in North Asia // Mikology and phytopathology, 56 (5), https://doi.org/10.31857/S0026364822050129
  • Dudka, V.A., 2022. A new species Exobasidium nannfeldtii on Rhododendron tomentosum from Russia//Nova Hedwigia, 115 (1-2), https://doi.org/110.1127/nova_hedwigia/2022/0703
  • Miller A.N., Dirks A.C., Filippova N., Popov E. and Methven A.S., 2022. Studies in Gyromitra II: cryptic speciation in the Gyromitra gigas species complex; rediscovery of G. ussuriensis and G. americanigigas sp. nov. // Mycological progress, 21 (9), https://doi.org/10.1007/s11557-022-01832-x
  • Filippova N., Ganasevich G., Filippov I., Meshcheryakova A., Lapshina E. and Karpov D., 2022. Yugra State University Biological Collection (Khanty-Mansiysk, Russia): general and digitisation overview // Biodiversity Data Journal, 10, https://doi.org/110.3897/BDJ.10.e77669
  • Shumskaya, M., Filippova, N., Lorentzen, L. et al., 2022. Citizen science helps in the study of fungal diversity in New Jersey // Sci Data, 10 (10), https://doi.org/10.1038/s41597-022-01916-z
  • Stolyarova A.V., Neretina T.V., Zvyagina E.A., Fedotova A.V., Kondrashov A.S. and Bazykin G.A., 2022. Complex fitness landscape shapes variation in a hyperpolymorphic species // Elife, 11, https://doi.org/10.7554/eLife.76073
  • Mingalimova A.I., Urbanavichene I.N., 2022. New species to the lichen flora of Russia and Western Siberia from Yamalo-Nenets Autonomous Area // Botanicheskii Zhurnal, 107 (12), https://doi.org/10.31857/S0006813622120079
  • Filippova NV, Kosykh NP, Filippov IV, Mescheryakova AV, 2023. Annual growth and primary production of sphagnum in raised bog “Mukhrino” (four-years observation: 2019-2022) // Environmental dynamics and global climate change, 14/1, https://doi.org/10.18822/edgcc472141
  • Filippova N.V., Zvyagina E.A., Bolshakov S.Yu., Rudykina E.A., Dobrynina A.S., 2023. The diversity of larger fungi of peatlands: nine years of plot-based monitoring with barcoding of revealed species in a raised bog “Mukhrino”, West Siberia // Biodiversity Data Journal, 11: e105111, https://doi.org/10.3897/BDJ.11.e105111
  • Kotkova V. M., Afonina O. M., Androsova V. I., Belyakov E. A., Bersanova A. N., Biryukova O. V., Butunina E. A., Chesnokov S. V., Davydov D. A., Davydov E. A., Doroshina G. Ya., Dugarova O. D., Filippova N. V., Frolov I. V., Glazunov V. A., Gorbunova I. A., Himelbrant D. E., Ignatova E. A., Iliushin V. A., Kirtsideli I. Yu., Konoreva L. A., Kuznetsova O. I., Makryi T. V., Melekhin A. V., Mongush Ch. B., Nikolaenko S. A., Nikolaev N. S., Notov A. A., Popova N. N., Rodina O. A., Romanov R. E., Rudykina E. A., Ryzhkova P. Yu., Ryzhova E. M., Sambyla Ch. N., Shestakova A. A., Sonina A. V., Stepanchikova I. S., Stepanova V. A., Storozhenko Yu. V., Tarasova V. N., Tsurykau A. G., Tubanova D. Ya., Tugi E. V., Vilnet A. A., Vishnyakov V. S., Vlasenko A. V., Vlasenko V. A., Yakovchenko L. S., Zhdanov I. S., Zhuykov K. A., Zibzeev E. G., Zvyagina E. A., 2023. New cryptogamic records. 12 // Novosti sistematiki nizshikh rastenii, 57(2), https://doi.org/10.18822/edgcc472141
  • Dudka VA, 2023. The first record of Kordyana commelinae (Brachybasidiaceae, Exobasidiomycetes) on Commelina communis in the Russian Far East (Primorsky Krai) // Nova Hedwigia, 116: 3-4, https://doi.org/10.31111/nsnr/2023.57.2.R1
  • Kalinina L.B., Ageev D.V., Bulyonkova T.M., 2023. Hohenbuehelia filicina sp. nov., a new species of Hohenbuehelia from Southwestern Siberia, Russia // Phytotaxa, 600: 5, https://doi.org/10.11646/phytotaxa.600.5.2
  • He M.-Q., B. Cao, F. Liu, T. Boekhout, T. T. Denchev, N. Schoutteten, C. M. Denchev, M. Kemler, S. P. Gorjón, D.Begerow, R. Valenzuela, N. Davoodian, T. Niskanen, A. Vizzini, S. A. Redhead, V. Ramírez-Cruz, V. Papp, V. A. Dudka, A. K. Dutta, R. García-Sandoval, X.-Z. Liu, T. Kijpornyongpan, A. Savchenko, L. Tedersoo, B. Theelen, L. Trierveiler-Pereira, F. Wu, J. C. Zamora, X.-Y. Zeng, L.-W. Zhou, S.-L. Liu, M. Ghobad-Nejhad, A. J. Giachini, G.-J. Li, M. Kakishima, I. Olariaga, D. Haelewaters, B. Sulistyo, J. Sugiyama, S. Svantesson, A. Yurkov, P. Alvarado, V. Antonín, A. F. da Silva, I. Druzhinina, T. B. Gibertoni, L. Guzmán-Dávalos, A. Justo, S. C. Karunarathna, M. C. A. Galappaththi, M. Toome-Heller, T. Hosoya, K. Liimatainen, R. Márquez, A. Mešić, J.-M. Moncalvo, L. G. Nagy, T. Varga, T. Orihara, T. Raymundo, I.Salcedo, A. G. S. Silva-Filho, Z. Tkalčec, F. Wartchow, C.-L. Zhao, T. Bau, Milay C.Hernández, A. Cortés-Pérez, C. Decock, R. De Lange, M.Weiß, N. Menolli Jr., R. H. Nilsson, Y.-G. Fan, A. Verbeken, Y. Gafforov, A. Meiras-Ottoni, R. L. M.-A., Nian-K. Zeng, Q. Wu, K. D. Hyde, P. M. Kirk, R.-L. Zhao, 2023. Phylogenomics, divergence times and notes of orders in Basidiomycota // Fungal Diversity [submitted to the journal]
  • Filippova N, Zvyagina E, Rudykina E, Ishmanov T, Filippov I, Bulyonkova T, Dobrynina A, 2024. DNA-based occurrence dataset on peatland fungal communities studied by metabarcoding in Northwestern Siberia // Biodiversity Data Journal, [submitted to the journal],
  • Ageev DV, Bulyonkova TM, Zvyagina EA, Filippova NV, 2024. Hohenbuehelia incrustata sp. nov., a new species of Hohenbuehelia (Pleurotaceae, Agaricales) from Northwestern Siberia, Russia // Phytotaxa [submitted to the journal]
  • Zvyagina EA, Sazanova NA, 2024. Suillus kovalenkoi (Boletales, Agaricomycetes), a new Larix-associated species from North Asia // Phytotaxa [submitted to the journal],
  • Lapshina ED, Filippov IV, Verevkina ED, Ganasevich GN, 2023-2024. Syntaxonomy of the Numto Nature Park vegetation (north taiga, Western Siberia):1.Vaccinio-Piceetea Br.-Bl. in Br.-Bl et al. 1939 // Botanica Pacifica. A journal of plant science and conservation, 13(1), https://doi.org/10.17581/bp.2023.13106

Тезисы и материалы конференций

  • Рудыкина Е.А., Филиппова Н.В., Звягина Е.А., 2024. К ревизии видового состава макромицетов верховых болот: Cortinarius spp. в коллекции Фунгария Югорского университета // Проблемы рационального природопользования и история геологического поиска в Западной Сибири: Сб. тезисов XI региональной молодёжной конференции имени В.И. Шпильмана, Ханты-Мансийск: Югорский, ISBN 978-5-6046134-7-4 (pdf)
  • Добрынина А.С., Филиппова Н.В., 2024. Метабаркодинг сообщества грибов мертвой древесины: стандартный субстрат как метод изучения сукцессии // Проблемы рационального природопользования и история геологического поиска в Западной Сибири: Сб. тезисов XI региональной молодёжной конференции имени В.И. Шпильмана, Ханты-Мансийск: Югорский, ISBN 978-5-6046134-7-4 (pdf)
  • Белик А.А., Филиппова Н.В., 2024. Микоризные сообщества грибов верховых болот (на примере стационара Мухрино ЮГУ) // Проблемы рационального природопользования и история геологического поиска в Западной Сибири: Сб. тезисов XI региональной молодёжной конференции имени В.И. Шпильмана, Ханты-Мансийск: Югорский, ISBN 978-5-6046134-7-4 (pdf)
  • Добрынина АС, Филиппова НВ. 2024. Эксперимент со стандарнтым субстратом для изучения сообществ дереворазрушающих грибов (анализ методом метабаркодинга) // Молодёжная наука Севера = Youth Science of the North : сборник материалов I Международной научно-практической конференции (Ханты-Мансийск,12–13 декабря 2023): в 3 частях. Ч. 1. Ханты-Мансийск: Сектор редакционно-издательской работы ЮГУ. 42-50 (pdf)
  • Попеску КВ, Филиппова НВ. 2024. Коллекция культур макромицетов верховых болот на базе Фунгария ЮГУ // Молодёжная наука Севера = Youth Science of the North : сборник материалов I Международной научно-практической конференции (Ханты-Мансийск,12–13 декабря 2023): в 3 частях. Ч. 1. Ханты-Мансийск: Сектор редакционно-издательской работы ЮГУ. 141-147 (pdf)
  • Лутовинова ВА, Филиппова НВ. 2024. Культивирование съедобных грибов в условиях Ханты-Мансийска // Молодёжная наука Севера = Youth Science of the North : сборник материалов I Международной научно-практической конференции (Ханты-Мансийск,12–13 декабря 2023): в 3 частях. Ч. 1. Ханты-Мансийск: Сектор редакционно-издательской работы ЮГУ. 119-128 (pdf)

Last update: 01.03.2024