Первая молекулярно-валидированная база данных паутинников (Cortinarius) Западной Сибири
Первый в своем роде каталогизированный набор данных из 624 образцов Cortinarius из Западной Сибири и сопредельных территорий, подтвержденных ITS/28S последовательностями.
Ссылка на видео-презентацию проекта в рамках Научных семинаров лаборатории.
Род Cortinarius – крупнейшая группа эктомикоризных грибов бореальных лесов, отличающаяся колоссальным разнообразием и сложной таксономией. Несмотря на полуторавековую историю изучения в России, регион Западной Сибири не имел современного, молекулярно-верифицированного каталога этого рода.
- ~2500 образцов рода Cortinarius в коллекции ЮГУ
- 711 отобраны для секвенирования
- биоинформатический пайплайн с контролем качества
- таксономическая идентификация: BLAST-анализ против баз UNITE/NCBI
Географический охват
63% образцов – ХМАО, 32% – Новосибирская область. Основные локации: окрестности Угута (22%), Новосибирск (16%), Шапша (15%), Мухрино (12%), Караканский бор (12%), Юганский заповедник (9%).
Временной охват сбора коллекций: 2005–2024 гг.
Результаты
- 212 видов Cortinarius s.l. (86 представлены единичными образцами, 7 видов – 10–21 образцом)
- 17% идентификаций подтверждены высоким сходством с типовыми материалами
- 624 образца снабжены качественными сиквенсами
Данные депонированы в международные репозитории
- GBIF (обогащенный набор данных с изображениями и последовательностями)
- SRA (сырые чтения)
- GenBank (обработанные последовательности)
- Код анализа доступен на GitHub или в виде архива (скачать)
- Видео-комментарий пояснение к коду (видео запись)
- Архив исходных данных на портале Zenodo
Таблица данных доступна для скачивания (содержит данные об образцах, ссылки на изображения, данные сиквенсов) (скачать csv файл)
Поддержка: Грант Фонда научно-технологического развития Югры № 2024-514-04, РНФ № 5-24-20145.
Рудыкина ЕА, Филиппова НВ, 2024. Начало ревизии разнообразия рода Cortinarius таежных лесов Западной Сибири // XXXI Всероссийская молодежная научная конференция Актуальные проблемы биологии и экологии (с элементами научной школы»), г. Сыктывкар, 18-22 марта 2024 (тезисы доклада)
Рудыкина Е.А., 2024. К ревизии разнообразия рода Cortinarius средне-таежных лесов Западной Сибири // Ломоносов 2024 (секция Микология и Альгология), г. Москва, 15-17 апреля 2024 (тезисы доклада)
Рудыкина Е.А., Звягина Е.А., 2025. Разнообразие Cortinarius subgen. Dermocybe лесных и болотных экосистем тайги // VI (XIV) Международная ботаническая конференция молодых учёных в Санкт-Петербурге 21—25 апреля 2025 года, c. 155 (тезисы доклада)
Filippova NV, Bulyonkova TM, Zvyagina EA, Ageev AD, Rudykina EA, 2026. Cortinarius barcoding database of Western Siberia and adjacent areas // Biodiversity data Journal (статья на рецензировании)