FUNGAL LITERATURE RECORDS DATABASE OF THE NORTHERN WEST SIBERIA

The mycological research in the Northern part of West Siberia stems from isolated studies in the beginning of the 20th century, but regular and systematic research dates back to the 1970-80s. Over the following decades several dozens of researches have worked in the area and more than four hundred scientific works have been published. FUngal Records Database of Northern West Siberia (FuNWS) was developed to accumulate the results of previous studies of species distributions.

The FuNWS database includes 27 fields describing species name, publication source, herbarium number, date of sampling, locality information, vegetation, substrate, and others. The occurrences in the database were extracted from previously published works, no herbarium collections or other unpublished records were included in the database.

Presently, the dataset includes about 22 thousand of fungal occurrences recorded in the region, reported from about 150 scientific publications. According to the database summary report, there are about 3.3 thousand species identified within the region up-to-date. The richest studied classes are Agaricomycetes (45%) and Lecanoromycetes (30%) with totally 26 classes represented.


FuNWS was uploaded in GBIF (YSU BC publisher) by 11 November 2017 and available from GBIF:

Filippova N, Arefyev S, Bulyonkova T, Zvyagina E, Kapitonov V, Makarova T, Mukhin V, Stavishenko I, Tavshanzhi E, Shiryaev A, Tolpysheva T, Sedelnikova N, Ryabitseva N, Paukov A, Zhurbenko M (2020). Fungal literature records database of the Northern West Siberia (Russia). Version 1.9. Yugra State University Biological Collection (YSU BC). Occurrence dataset https://doi.org/10.15468/hfje3l accessed via GBIF.org on 2020-03-16.

 

clusters_20km

(как только Илья Ф. перестанет бездельничать, он эту картинку обновит!)
Карта распростренения находок грибов по данным FReDY на 2017 г. Карта сделана И. Филипповым в QGIS, кластеризация точек проведена в радиусе 20 км, шаги шкалы выбраны вручную после построения гистограммы распределения частот.
Map of fungal records in FReDY for 2017. The map was made by Ilya Filippov in QGIS, clustering of points was made within a radius of 20 km, the scale breaks were selected manually after plotting the frequency distribution histogram.

База литературных данных о находках грибов Севера Западной Сибири

История микологических исследований на севере Западной Сибири начитается с изолированных исследований в начале XX века, однако более-менее организованные исследования на этой территории ведутся с его второй половины. В ходе этой истории, несколько десятков исследователей работало на территории, а общее число публикаций превышает 3 сотни. История микологических исследований в Ханты-Мансийском автономном округе – Югре детально описана в статьях (Filippova et al., 2017а; 2017b). Материалы по изученности отдельных групп организмов также опубликованы в ряде монографий и региональных чеклистов (Магомедова, Ектова, 2006; Магомедова, Ектова, Рябицева, 2006; Мухин, 1993). Единого чеклиста о грибах региона или региональной фунги до сих пор не существует, а находки видов хранятся в разрозненных и часто труднодоступных публикациях.

В последние годы в регионе реализуется программа оцифровки и мобилизации данных о биоразнообразии, объединяя разрозненные источники с помощью единых стандартов хранения на общедоступных информационных порталах. В рамках этой инициативы нами проведена работа по оцифровке и мобилизации данных о грибах и грибоподобных организмах, ранее опубликованных в научной печати. В результате оцифровки была создана база данных находок видов, известных с территории, которая может рассматриваться как цифровой аналог аннотированного чеклиста.

Основа базы данных была создана в 2016 году используя Google Sheets (онлайн таблицы гугла) для синхронного заполнения данных несколькими пользователями (Филиппова, Большаков, 2017). При создании структуры полей и формата данных использовали стандарт Darwin Core. Данные о находках видов экстрагировались из публикаций и вносились в базу данных коллективным усилием соавторов. Первая версия базы данных была посвящена только одному региону – Югре с названием Fungal records database of Yugra, FReDY. Позднее география была расширена до еще одного северного региона – Ямало-Ненецкого автономного округа, и переименована в соответствии: Fungal records Database of the Northern West Siberia, FuNWS. База данных была опубликована в Глобальной информационной системе по биоразнообразию GBIF (Filippova et al., 2020).

В задачи проекта по созданию базы FuNWS входила оцифровка всех публикаций, содержащих находки грибов и грибоподобных организмов на севере Западной Сибири (в границах двух административных регионов). Библиография работ по этой территории включает более 450 источников, из них около 150 содержат описания находок видов. Около 80% находок видов собраны относительно недавно, с начала 21 века.

В результате таксономического анализа полученной базы данных выявлено около 3300 видов грибов и грибоподобных организмов, отмеченных на территории севера Западной Сибири. Они представляют следующую таксономическую структуру: 1021 род, 293 семейства, 94 порядка, 26 классов, 5 фил и два царства (Fungi, Protozoa). База данных на момент подачи тезисов (15.03.2020) насчитывает около 22 тысяч записей. Наиболее богаты видами классы: Agaricomycetes (46%) and Lecanoromycetes (30%). Самые богатые семейства (30% от общего числа видов) представлены Parmeliaceae (144 вида), Russulaceae (111), Physciaceae (99), Cortinariaceae (96), Tricholomataceae (93), Polyporaceae (84), Lecanoraceae (83), Cladoniaceae (81), Hymenogastraceae (79), Ramalinaceae (67 видов).

Географическая структура данных различается по регионам и районам. Около 60% всех находок представлено из Югры, 27% из ЯНАО. Остальные находки происходят из сопредельных регионов, поскольку каждая публикация вносилась целиком, при наличии в ней находок из других регионов. Изученность территории в Югре более равномерная, чем на севере региона. Здесь почти все районы представлены находками видов, однако 80% находок происходят из четырех районов (Ханты-Мансийский, Сургутский, Березовский и Советский). В ЯНАО находки видов происходят из двух основных районов, 66% из Приуральского района и 22% – из Ямальского. Расположение районов исследований в регионе в целом разрозненное, без использования сети наблюдений. Однако большее число работ сосредоточено на природоохранных территориях, а около половины находок в базе имеют отношение к территории тринадцати ООПТ.

Last update: 16.03.2020